| 8. Round | 19/10/2008 | TSV 1860 München | - | SpVgg Greuther Fürth | 3:1 | ||||
| 11. Round | 31/10/2008 | SpVgg Greuther Fürth | - | SV Wehen Wiesbaden | 1:1 | ||||
| 16. Round | 05/12/2008 | 1. FSV Mainz 05 | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:1 |  |
|||
| 17. Round | 14/12/2008 | SpVgg Greuther Fürth | - | Rot Weiss Ahlen | 3:0 | ||||
| 18. Round | 01/02/2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC Ingolstadt 04 | 6:1 | ||||
| 20. Round | 13/02/2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | FSV Frankfurt | 0:0 | ||||
| 21. Round | 22/02/2009 | TuS Koblenz | - | SpVgg Greuther Fürth | 3:0 | ||||
| 24. Round | 15/03/2009 | VfL Osnabrück | - | SpVgg Greuther Fürth | 5:1 | ||||
| 25. Round | 22/03/2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | TSV 1860 München | 1:0 | |
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| 26. Round | 05/04/2009 | Alemannia Aachen | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:0 |  |
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| 28. Round | 19/04/2009 | SV Wehen Wiesbaden | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:1 | ||||
| 33. Round | 17/05/2009 | SpVgg Greuther Fürth | - | 1. FSV Mainz 05 | 0:2 | ||||
| 34. Round | 24/05/2009 | Rot Weiss Ahlen | - | SpVgg Greuther Fürth | 2:4 | |
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