DFB-Nachwuchsliga   M. W D L goals
  at home 1 1 0 0 3 : 2
  Away 1 0 1 0 1 : 1
  2 1 1 0 4 : 3
Bundesliga Nord/Nordost   M. W D L goals
  at home 9 3 1 5 18 : 25
  Away 8 3 2 3 13 : 15
  17 6 3 8 31 : 40
Sonderspielrunde   M. W D L goals
  at home 1 1 0 0 2 : 1
  1 1 0 0 2 : 1
overall   M. W D L goals
  at home 11 5 1 5 23 : 28
  Away 9 3 3 3 14 : 16
  Neutral Place 0 0 0 0 0 : 0
  20 8 4 8 37 : 44
DFB-Nachwuchsliga
2024/2025 Vorrunde Group B Holstein Kiel - FC St. Pauli 1:1 (1:1)
2024/2025 Vorrunde Group B FC St. Pauli - Holstein Kiel 3:2 (2:1)
Bundesliga Nord/Nordost
2022/2023 11. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 3:0 (1:0)
2021/2022 1. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 3:6 (2:3)
2019/2020 10. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 2:2 (1:1)
2017/2018 18. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 1:2 (0:2)
2017/2018 5. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 1:4 (0:2)
2016/2017 20. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 5:1 (3:1)
2016/2017 7. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 1:2 (1:0)
2015/2016 18. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 2:1 (0:1)
2015/2016 5. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 0:1 (0:1)
2014/2015 18. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 1:0 (1:0)
2014/2015 5. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 4:3 (2:1)
2013/2014 25. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 1:3 (1:1)
2013/2014 12. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 2:3 (0:0)
2012/2013 25. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 3:2 (2:1)
2012/2013 12. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 1:1 (1:1)
2004/2005 22. Round Holstein Kiel - FC St. Pauli 2:2 (1:2)
2004/2005 9. Round FC St. Pauli - Holstein Kiel 1:5 (0:2)
Sonderspielrunde
2023 Vorrunde Group K FC St. Pauli - Holstein Kiel 2:1 (2:1)

For games that were decided on penalties the score after 120 minutes will be included in the ranking