| 7. Round | 04/10/2008 | 1. FC Nürnberg II | - | SC Pfullendorf | 4:1 | ||||
| 12. Round | 08/11/2008 | SC Freiburg II | - | 1. FC Nürnberg II | 2:0 | ||||
| 15. Round | 29/11/2008 | 1. FC Nürnberg II | - | Eintracht Frankfurt II | 1:2 | ||||
| 16. Round | 06/12/2008 | SSV Reutlingen | - | 1. FC Nürnberg II | 0:4 | ||||
| 23. Round | 21/03/2009 | Viktoria Aschaffenburg | - | 1. FC Nürnberg II | 1:3 | ||||
| 24. Round | 28/03/2009 | SC Pfullendorf | - | 1. FC Nürnberg II | 1:2 |  |
|||
| 25. Round | 05/04/2009 | 1. FC Nürnberg II | - | SSV Ulm 1846 | 2:2 | ||||
| 26. Round | 19/04/2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | 1. FC Nürnberg II | 0:2 | ||||
| 29. Round | 09/05/2009 | 1. FC Nürnberg II | - | SC Freiburg II | 3:0 |
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